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[hal-02625363] Promises and challenges in insect-plant interactions

There is tremendous diversity of interactions between plants and other species. These relationships range from antagonism to mutualism. Interactions of plants with members of their ecological community can lead to a profound metabolic reconfiguration of the plants’ physiology. This reconfiguration can favour beneficial organisms and deter antagonists like pathogens or herbivores. Determining the cellular and molecular dialogue between plants, microbes, and insects, and its ecological and evolutionary implications is important for understanding the options for each partner to adopt an adaptive response to its biotic environment. Moving forward, understanding how such ecological interactions are shaped by environmental change and how we potentially mitigate deleterious effects will be increasingly important. The development of integrative multidisciplinary approaches may provide new solutions to the major ecological and societal issues ahead of us. The rapid evolution of technology provides valuable tools and opens up novel ways to test hypotheses that were previously unanswerable, but requires that scientists master these tools, understand potential ethical problems flowing from their implementation, and train new generations of biologists with diverse technical skills. Here, we provide brief perspectives and discuss future promise and challenges for research on insect–plant interactions building on the 16th International Symposium on Insect–Plant interactions (SIP) meeting that was held in Tours, France (2–6 July 2017). Talks, posters, and discussions are distilled into key research areas in insect–plant interactions, highlighting the current state of the field and major challenges, and future directions for both applied and basic research.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (David Giron) 26 May 2020

https://hal.inrae.fr/hal-02625363v1

[hal-01594930] Réponses et adaptations aux changements globaux : quels enjeux pour la recherche sur la biodiversité ? Prospective de recherche.

Réponses et adaptations aux changements globaux : quels enjeux pour la recherche sur la biodiversité ? Prospective de recherche.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Ophélie Ronce) 26 Sep 2017

https://hal.science/hal-01594930v1

[hal-04672656] Building integrated plant health surveillance: a proactive research agenda for anticipating and mitigating disease and pest emergence

In an era marked by rapid global changes, the reinforcement and modernization of plant health surveillance systems have become imperative. Sixty-five scientists present here a research agenda for an enhanced and modernized plant health surveillance to anticipate and mitigate disease and pest emergence. Our approach integrates a wide range of scientific fields (from life, social, physical and engineering sciences) and identifies the key knowledge gaps, focusing on anticipation, risk assessment, early detection, and multi-actor collaboration. The research directions we propose are organized around four complementary thematic axes. The first axis is the anticipation of pest emergence, encompassing innovative forecasting, adaptive potential, and the effects of climatic and cropping system changes. The second axis addresses the use of versatile broad-spectrum surveillance tools, including molecular or imaging diagnostics supported by artificial intelligence, and monitoring generic matrices such as air and water. The third axis focuses on surveillance of known pests from new perspectives, i.e., using novel approaches to detect known species but also anticipating and detecting, within a species, the populations or genotypes that pose a higher risk. The fourth axis advocates the management of plant health as a commons through the establishment of multi-actor and cooperative surveillance systems for long-term data-driven alert systems and information dissemination. We stress the importance of integrating data and information from multiple sources through open science databases and metadata, alongside developing methods for interpolating and extrapolating incomplete data. Finally, we advocate an Integrated Health Surveillance approach in the One Health context, favoring tailored and versatile solutions to plant health problems and recognizing the interconnected risks to the health of plants, humans, animals and the environment, including food insecurity, pesticide residues, environmental pollution and alterations of ecosystem services.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (S. Soubeyrand) 26 Aug 2024

https://hal.inrae.fr/hal-04672656v1

[hal-01578869] Analyse de risque phytosanitaire Ditylenchus dipsaci sur luzerne

Il est demandé à l’Anses de réaliser une ARP sur le nématode des tiges et bulbes (D.dipsaci) sur luzerne (M. sativa).L’ARP consiste à évaluer, selon des normes internationales1, 2 , les preuves biologiques etautres données scientifiques ou économiques pour déterminer si un organisme nuisibledoit être réglementé (ou déréglementé) et la nature des mesures phytosanitaireséventuelles à prendre à son égard. L’ARP s’attache à évaluer l'importance potentielle d'unorganisme nuisible particulier pour une zone clairement définie. Elle peut être initiée pourune ou plusieurs raisons, les plus fréquentes étant : l’identification d'une filière,l’identification d’un organisme nuisible, l’examen ou la révision d'une politique.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Philippe Castagnone-Sereno) 29 Aug 2017

https://hal.science/hal-01578869v1

[hal-01577495] Evaluation de risque simplifiée pour Xyllela fastidiosa

En vue de possible échanges sur la présente thématique à un prochain Comité Permanent Phytosanitaire (CPP) à Bruxelles, il est demandé à l’Anses de réaliser une Evaluation du Risque Simplifiée (ERS) pour le 29/06/2012. Cette ERS devra faire notamment un bilan de la situation de Xylella fastidiosa dans le monde, détailler la biologie de la bactérie, son cycle de développement, les conditions météo et exigences climatiques nécessaires à son développement ou l’observation des symptômes, ses plantes hôtes, les moyens de contamination possibles, ainsi que les moyens de contamination possibles, ainsi que les moyens de lutte disponibles.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Charles Manceau) 25 Aug 2017

https://hal.science/hal-01577495v1

[hal-01228847] Analyse de risque phytosanitaire [i]Plasmopara halstedii[/i] agent responsable de la maladie du mildiou du tournesol

absent

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Frederic Suffert) 13 Nov 2015

https://hal.science/hal-01228847v1

[anses-05175671] Avis de l'Anses relatif à « la catégorisation de Cordylomera spinicornis »

L’Anses a été saisie le 27 janvier 2023 par la direction générale de l’alimentation du ministère de l’agriculture et de la souveraineté alimentaire pour la réalisation de l’expertise suivante : Catégorisation de huit espèces d’insectes exotiques dont Cordylomera spinicornis. CONTEXTE ET OBJET DE LA SAISINE Dans le cadre de la surveillance des organismes réglementés ou émergents (SORE), un dispositif de piégeage a été déployé par la DGAL en 2021 avec l’appui de l’INRAE et de l’ONF. L’objectif de ce dispositif est d’effectuer une surveillance passive dans les sites d’entrée ,potentiels (ports, aéroports, marché d’intérêt national (MIN)) des organismes réglementés ou émergents. Ce piégeage est qualifié de « large spectre » car il peut concerner plusieurs filières, de production suivies dans le cadre de la SORE (forêts, jardins et espaces verts et ,infrastructures (JEVI), arboriculture fruitière) en ciblant cependant majoritairement les insectes coléoptères des ligneux. Les principes de la surveillance mise en œuvre s’appuient sur les résultats précédemment acquis dans le cadre du projet PORTRAP, utilisant des pièges génériques multi-composés pour la détection précoce d’insectes exotiques xylophages dans les sites potentiels d’entrée sur le territoire national. Les pièges ont été disposés sur 13 sites (7 ports maritimes, 1 port fluvial, 4 aéroports et 1 marché national) dispersés sur le territoire (France continentale). Au total 9279 individus appartenant à 110 espèces différentes ont été capturés. Aucune espèce d’insecte de quarantaine prioritaire n’a été piégée. En revanche, la présence d’individus appartenant à 8 espèces de coléoptères exotiques, à priori non répandues sur notre territoire, des familles Cerambycidae et Curculionidae (sous-familles des Scolytinae et Platypodinae) a été relevée. Les 8 espèces d’insectes exotiques sont les suivantes : Cerambycidae : Cordylomera spinicornis (Fabricius, 1775), Trichoferus campestris (Faldermann, 1835), Xylotrechus chinensis (Chevrolat, 1852), Xylotrechus stebbingi Gahan, 1906 ; Curculionidae : Amasa sp. near truncata, Euplatypus hintzii (Schaufuss, 1897), Euplatypus parallelus (Fabricius, 1801), Xyleborus affinis Eichhoff, 1868. Ainsi, il est demandé la réalisation d’une catégorisation des 8 espèces d’insectes exotiques en utilisant les critères de risque listés ci-dessous, afin de déterminer leur nuisibilité et de prioriser sur cette base la réalisation d’analyses de risque portant sur ces insectes. Critères de risque a. Caractéristiques des espèces • Cycle biologique, • Plantes hôtes, • Symptômes, • Aires de distribution, • Nuisibilité dans ces aires de distribution, • Probabilité d’entrée et de transfert vers les plantes hôtes. b. Probabilité d’établissement • Présence d’hôtes appropriés, conditions climatiques et autres facteurs abiotiques favorables à l’établissement des 8 espèces d’insecte dans la zone ARP, • Identification d’ennemis naturels potentiels dans la zone ARP, et d’autres facteurs biotiques ainsi que les pratiques culturales pouvant contribuer à empêcher leur établissement, • Définition des zones d’établissement potentielles dans la zone ARP. c. Probabilité de dissémination • Moyens de dissémination (naturelle et assistée) dans la zone ARP, • Magnitude de la dissémination des 8 espèces d’insecte. d. Conséquences potentielles • Évaluation de l’impact économique en terme de production, associé aux 8 espèces d’insectes pour l’agriculture, la sylviculture et l’horticulture dans leur zone de répartition géographique actuelle et dans la zone ARP, • Évaluation de l’impact en JEVI dans la zone ARP. e. Conclusions des catégorisations des organismes nuisibles Dans cet avis, la catégorisation de Cordylomera spinicornis sera présentée

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Jean-Claude Gregoire) 22 Jul 2025

https://anses.hal.science/anses-05175671v1

[hal-01209971] R-SYST network : a French consortium for barcoding and species identification

absent

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Agnes Bouchez) 06 Jun 2020

https://hal.science/hal-01209971v1

[hal-01204276] R-Syst

R-SYST est un réseau national regroupant une douzaine d'équipes de recherche (de deux départements INRA : SPE et EFPA) impliquées dans la caractérisation moléculaire et morphologique d'organismes. Ces équipes sont composées de techniciens, chercheurs et ingénieurs dans les domaines de la biologie moléculaire, génétique et bioinformatique. Ils gèrent des bases de données et conçoivent et mettent à disposition des outils d'analyses de ces données taxonomiques.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Pierre Abad) 23 Sep 2015

https://hal.science/hal-01204276v1

[anses-04855184] Avis de L'Anses relatif à « la catégorisation de Trichoferus campestris »

Dans le cadre de la surveillance des organismes réglementés ou émergents (SORE), un dispositif de piégeage a été déployé par la DGAL en 2021 avec l’appui de l’INRAE et de l’ONF. L’objectif de ce dispositif est d’effectuer une surveillance passive dans les sites d’entrée potentiels (ports, aéroports, marché d’intérêt national (MIN) des organismes réglementés ou émergents. Ce piégeage est qualifié de « large spectre » car il peut concerner plusieurs filières de production suivies dans le cadre de la SORE (forêts, jardins et espaces verts et infrastructures (JEVI), arboriculture fruitière) en ciblant cependant majoritairement les insectes coléoptères des ligneux. Les principes de la surveillance mise en œuvre s’appuient sur les résultats précédemment acquis dans le cadre du projet PORTRAP, utilisant des pièges génériques multi-composés pour la détection précoce d’insectes exotiques xylophages dans les sites potentiels d’entrée sur le territoire national. Les pièges ont été disposés sur 13 sites (7 ports maritimes, 1 port fluvial, 4 aéroports et 1 marché national) dispersés sur le territoire (France continentale). Au total 9279 individus appartenant à 110 espèces différentes ont été capturés. Aucune espèce d’insecte de quarantaine prioritaire n’a été piégée. En revanche, la présence d’individus appartenant à 8 espèces de coléoptères exotiques, a priori non répandues sur notre territoire, des familles Cerambycidae et Curculionidae (sous-familles des Scolytinae et Platypodinae) a été relevée. Les 8 espèces d’insectes exotiques sont les suivantes : Cerambycidae : Cordylomera spinicornis (Fabricius, 1775), Trichoferus campestris (Faldermann, 1835), Xylotrechus chinensis (Chevrolat, 1852), Xylotrechus stebbingi Gahan, 1906 ; Curculionidae : Amasa sp. near truncata, Euplatypus hintzii (Schaufuss, 1897), Euplatypus parallelus (Fabricius, 1801), Xyleborus affinis Eichhoff, 1868. Ainsi, il est demandé la réalisation d’une catégorisation des 8 espèces d’insectes exotiques en utilisant les critères de risque listés ci-dessous, afin de déterminer leur nuisibilité et de prioriser sur cette base la réalisation d’analyses de risque portant sur ces insectes. Critères de risque a. Caractéristiques des espèces - Cycle biologique, - Plantes hôtes, - Symptômes, - Aires de distribution, - Nuisibilité dans ces aires de distribution, - Probabilité d’entrée et de transfert vers les plantes hôtes. b. Probabilité d’établissement - Présence d’hôtes appropriés, conditions climatiques et autres facteurs abiotiques favorables à l’établissement des 8 espèces d’insecte dans la zone ARP, - Identification d’ennemis naturels potentiels dans la zone ARP, et d’autres facteurs biotiques ainsi que les pratiques culturales pouvant contribuer à empêcher leur établissement, - Définition des zones d’établissement potentielles dans la zone ARP. c. Probabilité de dissémination - Moyens de dissémination (naturelle et assistée) dans la zone ARP, - Magnitude de la dissémination des 8 espèces d’insecte. d. Conséquences potentielles - Évaluation de l’impact économique en terme de production, associé aux 8 espèces d’insectes pour l’agriculture, la sylviculture et l’horticulture dans leur zone de répartition géographique actuelle et dans la zone ARP, - Évaluation de l’impact en JEVI dans la zone ARP. e. Conclusions des catégorisations des organismes nuisibles Dans cet avis, la catégorisation de Trichoferus campestris est présentée.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Jean-Claude Gregoire) 24 Dec 2024

https://anses.hal.science/anses-04855184v1

[anses-04608634] Avis de l'Anses relatif à « la catégorisation de Euplatypus hintzi »

Dans le cadre de la surveillance des organismes réglementés ou émergents (SORE), un dispositif de piégeage a été déployé par la DGAL1 en 2021 avec l’appui de l’INRAE et de l’ONF2. L’objectif de ce dispositif est d’effectuer une surveillance passive dans les sites d’entrée potentiels (ports, aéroports, marché d’intérêt national (MIN)) des organismes réglementés ou émergents (SORE). Ce piégeage est qualifié de « large spectre » car il peut concerner plusieurs filières de production suivies dans le cadre de la SORE (forêts, jardins et espaces verts et infrastructures (JEVI), arboriculture fruitière) en ciblant cependant majoritairement les insectes coléoptères ravageurs des ligneux. Les principes de la surveillance mise en œuvre s’appuient sur les résultats précédemment acquis dans le cadre du projet PORTRAP, utilisant des pièges génériques multi-composés pour la détection précoce d’insectes exotiques xylophages dans les sites potentiels d’entrée sur le territoire national. Les pièges ont été disposés sur 13 sites (7 ports maritimes, 1 port fluvial, 4 aéroports et 1 marché national) dispersés sur le territoire (France métropolitaine continentale). Au total 9279 individus appartenant à 110 espèces différentes ont été capturés. Aucune espèce d’insecte de quarantaine prioritaire n’a été piégée. En revanche, la présence d’individus appartenant à 8 espèces de coléoptères exotiques, a priori non présents sur notre territoire, des familles Cerambycidae et Curculionidae (sous-familles des Scolytinae et Platypodinae) a été relevée. Les 8 espèces d’insectes exotiques sont les suivantes : - Cerambycidae : Cordylomera spinicornis (Fabricius, 1775), Trichoferus campestris (Faldermann, 1835), Xylotrechus chinensis (Chevrolat, 1852), Xylotrechus stebbingi Gahan, 1906 ; - Curculionidae : Amasa sp. near truncata, Euplatypus hintzii (Schaufuss, 1897), Euplatypus parallelus (Fabricius, 1801), Xyleborus affinis Eichhoff, 1868.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Jean-Claude Gregoire) 11 Jun 2024

https://anses.hal.science/anses-04608634v1

[hal-01577510] Evaluation de risque simplifiée pour les Lethal yellowing type syndromes (LYTS)

La Direction Générale de l’Alimentation du ministère en charge de l’agriculture a saisi l’Anses en vue de la réalisation d’une évaluation du risque simplifiée (ERS) des LYTS. Ce travail a pour but notamment d’évaluer le risque d’introduction et l’impact économique des LYTS dans la zone ARP. La zone ARP à considérer comprend la Martinique, la Guadeloupe, la Guyane, la Réunion et Mayotte.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Michel Dollet) 25 Aug 2017

https://hal.science/hal-01577510v1

[anses-04718536] Avis de l'Anses relatif à « la catégorisation de Amasa parviseta »

Dans le cadre de la surveillance des organismes réglementés ou émergents (SORE), un dispositif de piégeage a été déployé par la DGAL en 2021 avec l’appui de l’INRAE et de l’ONF. L’objectif de ce dispositif est d’effectuer une surveillance passive dans les sites d’entrée potentiels (ports, aéroports, marché d’intérêt national (MIN)) des organismes réglementés ou émergents (SORE). Ce piégeage est qualifié de « large spectre » car il peut concerner plusieurs filières de production suivies dans le cadre de la SORE (forêts, jardins et espaces verts et infrastructures (JEVI), arboriculture fruitière) en ciblant cependant majoritairement les insectes coléoptères des ligneux. Les principes de la surveillance mise en œuvre s’appuient sur les résultats précédemment acquis dans le cadre du projet PORTRAP, utilisant des pièges génériques multi-composés pour la détection précoce d’insectes exotiques xylophages dans les sites potentiels d’entrée sur le territoire national. Les pièges ont été disposés sur 13 sites (7 ports maritimes, 1 port fluvial, 4 aéroports et 1 marché national) dispersés sur le territoire (France métropolitaine continentale). Au total 9279 individus appartenant à 110 espèces différentes ont été capturés. Aucune espèce d’insecte de quarantaine prioritaire n’a été piégée. En revanche, la présence d’individus appartenant à 8 espèces de coléoptères exotiques, a priori non présents sur notre territoire, des familles Cerambycidae et Curculionidae (sous-familles des Scolytinae et Platypodinae) a été relevée. Les 8 espèces d’insectes exotiques sont les suivantes : - Cerambycidae : Cordylomera spinicornis (Fabricius, 1775), Trichoferus campestris (Faldermann, 1835), Xylotrechus chinensis (Chevrolat, 1852), Xylotrechus stebbingi Gahan, 1906 ; - Curculionidae : Amasa sp. near truncata, Euplatypus hintzii (Schaufuss, 1897), Euplatypus parallelus (Fabricius, 1801), Xyleborus affinis Eichhoff, 1868.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Jean-Claude Gregoire) 02 Oct 2024

https://anses.hal.science/anses-04718536v1

[anses-04616086] Avis de l'Anses relatif à « l’avenant à la saisine de catégorisation de 8 espèces d’insectes exotiques incluant Xylotrechus chinensis »

Xylotrechus chinensis (XYLOCH) est un insecte longicorne originaire de la région paléarctique orientale (Chine, Corée du Nord, Corée du Sud, Japon et Taïwan) dont la présence a été signalée pour la première fois sur le territoire de l’Union européenne (UE) en Espagne (depuis 2013 en Catalogne, 2018 à Valence), en Grèce (depuis 2017 en Crète, 2019 à Athènes), en France (depuis 2017 en Occitanie, 2018 en Nouvelle-Aquitaine) et en Italie (depuis 2023 en Lombardie) où il cause des dégâts sur mûrier platane (Morus bombycis). Selon les données scientifiques fournies précédemment par l’Anses et dans un avis de l’EFSA publié en 2021 , cet organisme nuisible se développe préférentiellement dans les arbres de la famille des Moraceae (Morus alba, M. bombycis et M. australis). X. chinensis est inscrit depuis 2018 sur la liste d'alerte de l'OEPP . Dans son avis de 2021, l’EFSA indique que cet organisme remplit les critères pour être catégorisé comme organisme de quarantaine de l'Union européenne (UE) sans prendre en compte les éventuelles sous-espèces et en précisant comme autre source d'incertitude la réelle étendue de sa présence sur le territoire européen. Sur le territoire français X. chinensis a été classé temporairement comme organisme réglementé en 2022. Des actions de surveillance ont été conduites pour tenter de délimiter le périmètre des foyers observés et d’identifier les potentiels impacts. Des échanges ont eu lieu ultérieurement au niveau de l’UE concernant la possibilité de réglementer cet organisme sur le territoire de l’Union ; cette option n’a pas été retenue à ce stade compte tenu notamment des capacités de dispersion rapide de l’organisme nuisible et de son impact économique qui semble limité aux plantes du genre Morus. En France, la surveillance a mis en évidence des attaques sévères sur certains individus du genre Morus. Elle a également montré que les foyers concernent des surfaces importantes dans les régions de Sète et de Bordeaux; leur éradication ne semble pas réalisable d’autant qu’ils se situent dans des espaces urbanisés, ce qui complexifie la mise en œuvre de mesures de gestion. Pour autant, la mise en œuvre de mesures de lutte dans le but de maintenir un niveau de population le plus bas possible pour limiter les impacts et la propagation de l’organisme nuisible pourrait avoir du sens dans certains contextes compte tenu des éléments suivants : - les mûriers sont des arbres d’ornement dont la présence est relativement importante en particulier dans le sud de la France et certains de ces mûriers ont une valeur patrimoniale ; les foyers ont une surface encore limitée par rapport à l’aire de répartition des mûriers en France ; la gestion des arbres infestés peut représenter un enjeu de sécurité pour les municipalités ; même si jusqu’à présent, l’organisme n’a été identifié que sur mûrier dans l’UE, il n’est pas possible d’exclure à ce jour qu’il puisse s’attaquer à des espèces d’intérêt agronomique (des échanges sont en cours avec l’INRAE à ce sujet dans le but d’essayer de lever certaines incertitudes). (extrait)

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Jean-Claude Gregoire) 18 Jun 2024

https://anses.hal.science/anses-04616086v1

[anses-04353534] Avis de l'Anses relatif à « la catégorisation de Xylotrechus chinensis »

Dans le cadre de la surveillance des organismes réglementés ou émergents (SORE), un dispositif de piégeage a été déployé par la DGAL en 2021 avec l’appui de l’INRAE et de l’ONF. L’objectif de ce dispositif est d’effectuer une surveillance passive dans les sites d’entrée potentiels (ports, aéroports, marchés d’intérêt national (MIN) des organismes réglementés ou émergents (SORE). Ce piégeage est qualifié de « large spectre » car il peut concerner plusieurs filières de production suivies dans le cadre de la SORE (forêts, jardins et espaces verts et infrastructures (JEVI), arboriculture fruitière) en ciblant cependant majoritairement les insectes coléoptères des ligneux. Les principes de la surveillance mise en œuvre s’appuient sur les résultats précédemment acquis dans le cadre du projet PORTRAP, utilisant des pièges génériques multi-composés pour la détection précoce d’insectes exotiques xylophages dans les sites potentiels d’entrée sur le territoire national. Les pièges ont été disposés sur 13 sites (7 ports maritimes, 1 port fluvial, 4 aéroports et 1 marché national) dispersés sur le territoire (France continentale). Au total 9279 individus appartenant à 110 espèces différentes ont été capturés. Aucune espèce d’insecte de quarantaine prioritaire n’a été piégée. En revanche, la présence d’individus appartenant à 8 espèces de coléoptères exotiques, a priori non répandues sur notre territoire, des familles Cerambycidae et Curculionidae (sous-familles des Scolytinae et Platypodinae) a été relevée. Les 8 espèces d’insectes exotiques sont les suivantes : Cerambycidae : Cordylomera spinicornis (Fabricius, 1775), Trichoferus campestris (Faldermann, 1835), Xylotrechus chinensis (Chevrolat, 1852), Xylotrechus stebbingi (Gahan, 1906) ; Curculionidae : Amasa sp. near truncata, Euplatypus hintzii (Schaufuss, 1897), Euplatypus parallelus (Fabricius, 1801), Xyleborus affinis Eichhoff, 1868. Ainsi, il est demandé la réalisation d’une catégorisation des 8 espèces d’insectes exotiques en utilisant les critères de risque listés ci-dessous, afin de déterminer leur nuisibilité et de prioriser sur cette base la réalisation d’analyses de risque portant sur ces insectes.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Jean-Claude Grégoire) 19 Dec 2023

https://anses.hal.science/anses-04353534v1

[hal-01578870] Méthodes de lutte alternatives à l'épandage aérien de produits phytosanitaires contre les processionnaires du pin et du chêne en conditions urbaines

Contexte : Les chenilles processionnaires sont des insectes défoliateurs que l’on rencontre dans les populations de pins et de chênes et sont les formes larvaires de deux types de lépidoptères : Thaumetopoea pityocampa pour la processionnaire du pin et Thaumetopoea processionea pour la processionnaire du chêne. Leurs pullulations périodiques sont connues dans différentes régions, essentiellement le pourtour méditerranéen et la façade atlantique jusqu’au Pyrénées-Orientales pour la processionnaire du pin, et les régions d’Alsace, de Bourgogne, d’Ile-de-France, du Centre, de Poitou-Charentes et de Midi-Pyrénées pour la processionnaire du chêne. Les chenilles processionnaires de pin et du chêne sont responsables d’une dermite (appelée érucisme) en lien avec les poils urticants et allergisants qui recouvrent leur corps. A l’automne 2011, les professionnels de la forêt privée ont déposé auprès de l’Agence régionale de la santé (ARS) d’Aquitaine des dossiers de demande de traitements par voie aérienne des chenilles processionnaire du pin pour des motifs de protection de la santé publique. Ces demandes concernaient essentiellement des zones urbanisées. L’arrêté du 31 mai 2011 relatif aux conditions d’épandage des produits mentionnés à l’article L. 253-1 de code rural de la pêche maritime par voie aérienne prévoit cependant le respect d’une distance minimale de sécurité de 50 mètres vis-à-vis des habitations et jardins. Les traitements, qui doivent être mis en oeuvre à l’automne, n’ont donc pas été effectués en Aquitaine par voie aérienne en 2011. Dans ces conditions se pose la question des solutions alternatives qui seraient à mettre en oeuvre à l’avenir pour lutter contre les chenilles processionnaires du pin et du chêne dans les zones urbanisées, tant en Aquitaine que dans les autres régions concernées.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Robert Delorme) 29 Aug 2017

https://hal.science/hal-01578870v1

[hal-02653040] Permanent genetic resources added to molecular ecology resources database 1 august 2011-30 september 2011

This article documents the addition of 299 microsatellite marker loci and nine pairs of single-nucleotide polymorphism (SNP) EPIC primers to the Molecular Ecology Resources (MER) Database. Loci were developed for the following species: Alosa pseudoharengus, Alosa aestivalis, Aphis spiraecola, Argopecten purpuratus, Coreoleuciscus splendidus, Garra gotyla, Hippodamia convergens, Linnaea borealis,Menippe mercenaria,Menippe adina, Parus major, Pinus densiflora, Portunus trituberculatus, Procontarinia mangiferae, Rhynchophorus ferrugineus, Schizothorax richardsonii, Scophthalmus rhombus, Tetraponera aethiops, Thaumetopoea pityocampa, Tuta absoluta and Ugni molinae. These loci were cross-tested on the following species: Barilius bendelisis, Chiromantes haematocheir, Eriocheir sinensis, Eucalyptus camaldulensis, Eucalyptus cladocalix, Eucalyptus globulus, Garra litaninsis vishwanath, Garra para lissorhynchus, Guindilla trinervis, Hemigrapsus sanguineus, Luma chequen. Guayaba, Myrceugenia colchagu¨ensis, Myrceugenia correifolia, Myrceugenia exsucca, Parasesarma plicatum, Parus major, Portunus pelagicus, Psidium guayaba, Schizothorax richardsonii, Scophthalmus maximus, Tetraponera latifrons, Thaumetopoea bonjeani, Thaumetopoea ispartensis, Thaumetopoea libanotica, Thaumetopoea pinivora, Thaumetopoea pityocampa ena clade, Thaumetopoea solitaria, Thaumetopoea wilkinsoni and Tor putitora. This article also documents the addition of nine EPIC primer pairs for Euphaea decorata, Euphaea formosa, Euphaea ornata and Euphaea yayeyamana.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (S.W. A'Hara) 29 May 2020

https://hal.inrae.fr/hal-02653040v1

[hal-02487614] Effet bénéfique des régimes thermiques fluctuants sur la survie au froid des insectes : exploration des mécanismes sous-jacents

[...]

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Hervé Colinet) 21 Feb 2020

https://univ-rennes.hal.science/hal-02487614v1

[hal-03045949] Grassland-to-crop conversion in agricultural landscapes has lasting impact on the trait diversity of bees

Context Global pollinator decline has motivated much research to understand the underlying mechanisms. Among the multiple pressures threatening pollinators, habitat loss has been suggested as a key-contributing factor. While habitat destruction is often associated with immediate negative impacts, pollinators can also exhibit delayed responses over time. Objectives We used a trait-based approach to investigate how past and current land use at both local and landscape levels impact plant and wild bee communities in grasslands through a functional lens. Methods We measured flower and bee morphological traits that mediate plant–bee trophic linkage in 66 grasslands. Using an extensive database of 20 years of land-use records, we tested the legacy effects of the landscape-level conversion of grassland to crop on flower and bee trait diversity. Results Land-use history was a strong driver of flower and bee trait diversity in grasslands. Particularly, bee trait diversity was lower in landscapes where much of the land was converted from grassland to crop long ago. Bee trait diversity was also strongly driven by plant trait diversity computed with flower traits. However, this relationship was not observed in landscapes with a long history of grassland-to-crop conversion. The effects of land-use history on bee communities were as strong as those of current land use, such as grassland or mass-flowering crop cover in the landscape. Conclusions Habitat loss that occurred long ago in agricultural landscapes alters the relationship between plants and bees over time. The retention of permanent grassland sanctuaries within intensive agricultural landscapes can offset bee decline.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Gaëtane Le Provost) 17 Oct 2023

https://hal.science/hal-03045949v1

[hal-04186404] Mécatronique et deep learning au service de l’automatisation des suivis de biodiversité en forêt

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ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Christophe Bouget) 23 Aug 2023

https://hal.inrae.fr/hal-04186404v1

[hal-04186438] Bioc@pt : Capteurs automatiques de biodiversité en forêt

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ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Christophe Bouget) 23 Aug 2023

https://hal.inrae.fr/hal-04186438v1

[hal-05585664] How to eradicate an invasive forest pest without clear‐cutting

Abstract The pine wood nematode (PWN), Bursaphelenchus xylophilus , is an invasive species causing high pine mortality in invaded areas outside its native range. European Union (EU) regulations stipulate a 500‐m radius clear‐cutting around infested trees to prevent the spread of PWN by the vector beetle Monochamus galloprovincialis , yet this measure is costly and not fully effective. We used an individual‐based model describing the dispersal of the insect vector and its transmission of PWN to compare the cost‐effectiveness of clear‐cutting and selective cutting of only the PWN‐infested trees for three different methods for surveillance: visual ground surveys, aerial surveys and insect trap networks. Both strategies eradicated PWN if intensive aerial surveillance was conducted at a time that all infested trees showed symptoms. Selective cutting reduced costs by up to a factor of 200 compared to clear‐cutting, mainly due to the preservation of healthy trees. Additionally, selective cutting reduces environmental and societal costs. However, eradication is unlikely if symptom expression of infectious trees is incomplete at the time of survey. Policy implications. The results show that selective cutting applied together with modern remote sensing surveillance methods is an environmentally friendly alternative to the mandatory clear‐cutting for PWN control in the EU.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Hongyu Sun) 09 Apr 2026

https://hal.inrae.fr/hal-05585664v1

[tel-05371081] Comparative approach to invasiveness in congeneric bark beetles : the case of the Hylurgini group

Bark beetles (Coleoptera: Curculionidae : Scolytinae) include several invasive species that cause significant ecological and economic damage. This thesis investigates the traits associated with invasion success in congeneric bark beetles of the Hylurgini tribe by comparing three species pairs, each consisting of one invasive and one non-invasive species. Chapter 1 reviews life-history traits and shows that invasive species often exhibit a broader host range, greater ecological plasticity, and a history of multiple introductions. However, invasion success depends on a complex interaction between intrinsic species traits and external environmental and anthropogenic factors. Chapter 2 presents the complete mitochondrial genomes of seven Hylurgini species and reconstructs their phylogeny based on 13 protein-coding genes. These data clarify evolutionary relationships within the group and facilitate molecular identification and phylogeographic studies. Chapter 3 compares two species of the genus Hylurgus, namely invasive H. ligniperda and non-invasive H. micklitzi, which coexist in various regions of Europe. The study reveals substantial genetic diversity in H. ligniperda, along with phylogeographic population structuring likely shaped by multiple postglacial refugia, whereas H. micklitzi shows lower diversity and weaker structure. This thesis highlights the importance of comparative and integrative approaches to better understand biological invasions and to strengthen forest biosecurity strategies.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Yuan Yuan) 18 Nov 2025

https://theses.hal.science/tel-05371081v1

[tel-04622319] Approches génomiques pour la biodétection d'insectes invasifs forestiers

Les invasions biologiques, en particulier celles d'insectes xylophages comme les Cérambycides, sont en constante augmentation, principalement en raison du changement climatique et de l'intensification des échanges commerciaux. Ces insectes, transportés principalement par le commerce international du bois, s'établissent dans de nouveaux écosystèmes dans lesquels ils n'ont pas forcément d'ennemis naturels. Une fois établis, ils peuvent causer des dégâts considérables aux forêts et aux zones urbanisées, menaçant ainsi la biodiversité, l'économie et la santé des écosystèmes. Ces invasions nécessitent donc une surveillance et une gestion rigoureuses pour prévenir et atténuer leurs impacts dévastateurs.Dans ce contexte, cette thèse a pour objectifs principaux : (i) évaluer l'efficacité du métabarcoding, une méthode permettant d'identifier simultanément et rapidement plusieurs espèces d'insectes collectées dans un même piège, en utilisant le séquenceur MinION d'Oxford Nanopore®. Ce séquenceur présente l'avantage d'être portatif et peu couteux, le rendant ainsi plus accessible que les technologies concurrentes. (ii) Créer une librairie de référence de codes-barres moléculaires pour les Cerambycides européens afin de fournir à la communauté scientifique une base de données pour effectuer des analyses fiables d'identification basées sur l'ADN. (iii) Étudier la structure génétique des populations invasives d'une espèce exotique introduit dans le bassin méditerranéen (Xylotrechus stebbingi) afin de mieux comprendre sa dynamique d'invasion de cet insecte originaire d'Asie.Concernant le premier objectif de cette thèse, nos résultats ont montré que le séquenceur MinION d'Oxford Nanopore® était performant pour la détection et l'identification rapide d'espèces invasives, par comparaison aux technologies de séquençage Illumina® et IonTorrent. Nos résultats montrent également que la méthode de piégeage et de préservation des échantillons dans les pièges est un prérequis essentiel qui conditionne la détection fiable des espèces présentes dans les échantillons. En ce qui concerne le deuxième chapitre, nous avons pu assembler 2928 séquences de codes-barres ADN pour 147 espèces de cérambycidés, soit plus de 79% des 185 espèces capturées en Europe à l'aide de pièges multi-phéromonaux. Cette nouvelle base de données pourrait être utilisée pour identifier avec précision le contenu des pièges multi-phéromonaux déployés en Europe lors d'analyses de codes-barres ou de métabarcodes. Enfin, dans le troisième chapitre de cette thèse, nous avons mis en évidence que l'invasion du xylophage Xylotrechus stebbingi dans le bassin méditerranéen résultait d'une série d'introductions multiples, probablement en lien avec les échanges commerciaux maritimes plutôt qu'à une unique introduction qui se serait propagée au fil du temps. Ces résultats impliquent que cette espèce, hautement polyphage et à fort potentiel invasif, risque d'envahir de nouvelles régions du monde (en dehors du bassin méditerranéen) dans les prochaines années via le transport maritime. Par conséquent, il est nécessaire de rester vigilant dans les zones portuaires afin de limiter au maximum la propagation de cet insecte.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Loïs Veillat) 24 Jun 2024

https://theses.hal.science/tel-04622319v1

[tel-04368466] Structure génétique et modélisation de la distribution des populations de deux espèces invasives de Xylosandrus (Scolytinae - Xyleborini) : deux espèces proches aux histoires d’invasion différentes

Xylosandrus compactus et X. crassiusculus sont deux scolytes originaires d’Asie du Sud-Est et invasifs sur plusieurs continents, dont la biologie et l’écologie atypiques favorisent l’invasion. Une approche pluridisciplinaire a été utilisée au cours de cette thèse afin (i) d’identifier l’origine des populations invasives et leurs routes d’invasion, et (ii) de déterminer les zones dans lesquelles elles pourraient s'étendre et s’établir. Les routes d’invasion ont été retracées à l’aide d’un marqueur mitochondrial et de marqueurs génomiques, et les zones favorables à l’établissement de chaque espèce ont été déterminées à l’aide de modèles de distribution d’espèces (SDM). Malgré leur proximité écologique et phylogénétique, les deux espèces ont une histoire d’invasion différente. Deux lignées ont été identifiées chez X. compactus, l’une originaire d’Inde ou du Vietnam ayant envahi l’Afrique et l’autre originaire de la région de Shanghai et ayant envahi indépendamment les Amériques et les îles du Pacifique, puis l’Europe. X. crassiusculus est composé de deux clusters très divergents, majoritairement allopatriques et possédant des niches écologiques différentes. Le cluster 1 a envahi indépendamment les îles du Pacifique et l’Afrique. Le cluster 2 est responsable de l’invasion en Amérique, en Europe, en Afrique et en Océanie, avec plusieurs invasions indépendantes de multiples origines (dont des événements dits "tête de pont") suivies de dispersion intra-continentale. Les SDM ont montré pour les deux espèces l’existence de zones favorables où elles ne sont pas encore présentes et qui sont donc susceptibles d’être envahies secondairement. Nous anticipons également un impact du changement climatique sur leurs potentielles distributions futures. A l'inverse, l'évolution récente du climat n'est pas responsable de l'invasion récente de l'Europe, ce continent étant favorable depuis plusieurs décennies.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Teddy Urvois) 01 Jan 2024

https://theses.hal.science/tel-04368466v1

[tel-03893426] Modélisation de la phénologie d'une espèce emblématique du changement climatique : la processionnaire du pin

Face au changement climatique, des modifications de la distribution et de la phénologie des espèces ont été observées. La processionnaire du pin (PP) (Thaumetopoea pityocampa) est considérée comme un modèle d’étude pour comprendre l’effet du réchauffement climatique sur la distribution des espèces car sa distribution s’étend en réponse à l’augmentation des températures hivernales. La PP est un ravageur forestier à impact économique et sanitaire. L’apparition de processions précoces atypiques dans certaines régions a été observée ces dernières années. Cependant, les conséquences du changement climatique sur sa phénologie restent encore peu connues. Une meilleure compréhension des variations spatiales et temporelles de la phénologie est cruciale, non seulement pour mieux comprendre l’effet du changement climatique sur la PP, mais aussi pour optimiser les méthodes de lutte et prévenir des risques d’urtication étant donné qu’il est nécessaire pour cela de savoir quand les différents stades larvaires sont présents. Afin de tester l’hypothèse d’une variation de la phénologie dans le temps (du fait du changement climatique) et dans l’espace (du fait des différents types de climats rencontrés en France), des suivis de la période de vol, du développement larvaire et de la période de procession ont été réalisés de 2018 à 2021 dans plusieurs régions biogéographiques en France. Ces données ont été comparées aux données historiques datant des années 1970-1980. Un potentiel étalement du vol et peu de variation dans la période de procession ont été mis en évidence. La phénologie de l’espèce varie dans l’espace en fonction des températures de l’été, de la date des premiers gels et de la rigueur de l’hiver. Afin d’identifier les mécanismes responsables de ces variabilités phénologiques, un modèle mathématique a été développé pour prédire les stades phénologiques de l’œuf jusqu’au dernier stade larvaire. Celui-ci a été calibré sur les courbes de performances thermiques des différents stades de la PP, obtenues en conditions contrôlées, à partir de la population d’Orléans. Les valeurs des paramètres de ces courbes étaient effectivement différentes selon les stades. Le modèle a ensuite été validé de manière indépendante grâce aux données de suivis réalisés à Orléans durant l’étude. L’augmentation de la température globale et/ou des vagues de chaleur en automne expliqueraient l’occurrence de processions précoces. Face au changement climatique, ces processions devraient donc être plus fréquentes. Le modèle a ensuite été testé sur cinq autres populations suivies durant cette étude, situées dans des régions climatiques différentes. Celui-ci rend bien compte de la variabilité spatiale de la phénologie observée. Le modèle phénologique prend comme variable la température de l’air. Or, les larves se trouvent dans un nid de soie. Dans le but de déterminer et simuler le microclimat associé au nid, un modèle biophysique a été développé. Le nid confère un microclimat chaud pouvant impacter le développement et potentiellement la survie des larves. En mesurant la tolérance thermique des différents stades larvaires,différents seuils thermiques ont été identifiés. Les résultats obtenus dans cette thèse montrent qu’il est important de considérer les contraintes de développement et de survie de chaque stade afin de prédire correctement l’effet des conditions climatiques sur la phénologie et la survie de la PP. Ils montrent aussi clairement que les changements de phénologie de la PP sont en lien avec le changement climatique. Ainsi la PP pourrait être un modèle d’étude pour comprendre l’effet du changement climatique sur la distribution et la phénologie des espèces, deux composantes étroitement liées.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Laura Poitou) 11 Dec 2022

https://theses.hal.science/tel-03893426v1

[hal-05065278] European forests are under increasing pressure from global change-driven invasions and accelerating epidemics by insects and diseases

<div><p>Rising temperatures attributed to anthropogenic climate change have held a firm grip on European forests for over two decades now and disturbances have increased substantially, mainly from insects and pathogens. Empirical evidence suggests a direct linkage between rising temperatures and increasing damage from native insects. Although the rapid spread of non-native invasive pests and pathogens is mainly driven by globalized trade and lacking tree species adaptation to locally new threats, climate change favors rapid range expansion of some invasive pests. Here, we present some examples of tree-insect-pathogen interactions in native and non-native systems that have experienced climate change-induced severe outbreak dynamics. We document the spread of damaging insects and pathogens into previously climatically unsuitable regions and underscore the severe forest damages such species distribution shifts can cause. Although systematic assessments are still pending, the information provided here by multiple independent empirical evidences is highly valuable for identifying some of the most pressing issues in European forest protection. Our work can guide for-est protection agencies in preparing mitigating strategies for upcoming decades.</p></div>

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Henrik Hartmann) 13 May 2025

https://hal.inrae.fr/hal-05065278v1

[hal-01607783] No saturation in the accumulation of alien species worldwide

Although research on human-mediated exchanges of species has substantially intensified during the last centuries, we know surprisingly little about temporal dynamics of alien species accumulations across regions and taxa. Using a novel database of 45,813 first records of 16,926 established alien species, we show that the annual rate of first records worldwide has increased during the last 200 years, with 37% of all first records reported most recently (1970-2014). Inter-continental and inter-taxonomic variation can be largely attributed to the diaspora of European settlers in the nineteenth century and to the acceleration in trade in the twentieth century. For all taxonomic groups, the increase in numbers of alien species does not show any sign of saturation and most taxa even show increases in the rate of first records over time. This highlights that past efforts to mitigate invasions have not been effective enough to keep up with increasing globalization.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Hanno Seebens) 27 May 2020

https://hal.science/hal-01607783v1

[hal-02822462] The ALARM field site network, an outstanding tool for the survey of invasive insects infesting seeds of wild roses in europe. Chapter 6: Biological invasions

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ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Marie-Anne Auger-Rozenberg) 06 Jun 2020

https://hal.inrae.fr/hal-02822462v1

[tel-02463831] Indentification des facteurs sous-tendant l'invasion fulgurante d'un insecte asiatique en Europe, la pyrale du buis : approche génétique et biologique

Depuis les années 1990, on observe une accélération de la vitesse de propagation après établissementd’une grande partie des insectes introduits accidentellement en Europe. L’invasion fulgurante de lapyrale du buis, Cydalima perspectalis, est un exemple de ce phénomène. Observée pour la premièrefois en 2007 en Allemagne, elle s’est ensuite propagée jusqu’au Caucase en une décennie. Il a étérapidement supposé que le commerce de buis d’ornement entre les pays européens et la Chine auraitpermis son introduction tandis que l‘intensification des échanges commerciaux entre pays européensaurait facilité sa propagation à travers le continent. Cependant, certains traits biologiques de l’insecteont également pu favoriser son invasion. Pour mieux comprendre les facteurs impliqués dans soninvasion fulgurante, une approche pluridisciplinaire a été utilisée au cours de cette thèse. Tout d’abord,les routes d’invasion ont été appréhendées avec deux types de marqueurs génétiques. Puis, deux traitsbiologiques ayant pu favoriser son établissement et son expansion ont été étudiés : ses capacités devol et la diapause. Les résultats génétiques ont permis de cibler la partie côtière de la Chine commezone source probable, et suggèrent au moins deux introductions indépendantes depuis la Chine suivipar un phénomène tête de pont probablement lié au commerce d’ornement. Les capacités de volestimées sont élevées et expliqueraient la dispersion de l’insecte à l’échelle locale. De plus, la sortie dediapause influencée par la température a pu permettre l’adaptation du nombre de générations enfonction du climat annuel. Ces deux traits biologiques ont par conséquent dû favoriser son invasion àl’échelle locale mais il apparaît que les activités humaines, en particulier le commerce des plantesornementales, ont joué un rôle majeur dans son invasion fulgurante à large échelle en Europe et auCaucase.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Audrey Bras) 02 Feb 2020

https://theses.hal.science/tel-02463831v1

[tel-01951721] Invasion du capricorne asiatique Anoplophora glabripennis : génétique, traits d’histoire de vie et écologie

Le capricorne asiatique Anoplophora glabripennis est un exemple d’insecte ayant bénéficié du commerce international depuis l’Asie pour envahir une partie de l’Amérique du Nord où il est présent depuis les années 1990, et de l’Europe où sa présence a été détectée au début des années 2000. Cette espèce hautement polyphage se développe dans les arbres urbains et peut causer leur mort, soulignant l’importance du contrôle de sa population. En utilisant une approche pluridisciplinaire sur la base du modèle A. glabripennis, cette thèse vise à apporter de nouveaux éléments pour la compréhension globale des invasions biologiques. Dans un premier temps, j’ai cherché à retracer son cheminement dans le monde. Dans un second temps, j’ai cherché à savoir si certaines de ses caractéristiques biologiques avaient contribué au succès de son invasion. Enfin, j’ai abordé la question de l’impact écologique d’A.glabripennis en me focalisant sur les modifications de la faune de xylophages que sa présence aurait pu entrainer. Les résultats obtenus au cours de cette thèse ont permis de mettre en évidence une invasion complexe incluant plusieurs introductions ainsi qu’un scénario de tête de pont entre l’Amérique du Nord et l’Europe. Il apparait également que certains traits de l’espèce ont contribué à modeler son schéma de distribution. Sa résistance au stress thermique notamment a probablement favorisé son installation sous des climats variés. Par ailleurs, la dispersion naturelle d’A. glabripennis semble très limitée, mais mes résultats indiquent que l’espèce n’est pas restreinte par ses capacités physiologiques pour disperser. Enfin, l’étude préliminaire des faunes envahies ne révèle pas pour le moment d’effet de l’espèce sur les autres Cérambycidés. Au regard des autres cas d’invasion documentés, le cas d’A.glabripennis souligne donc la diversité des caractéristiques des espèces devenant invasives, et confirme la difficulté d’en dresser un portrait type.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Marion Javal) 11 Dec 2018

https://theses.hal.science/tel-01951721v2

[hal-03846951] A large-scale dataset reveals taxonomic and functional specificities of wild bee communities in urban habitats of Western Europe

Wild bees are declining, mainly due to the expansion of urban habitats that have led to land-use changes. Effects of urbanization on wild bee communities are still unclear, as shown by contrasting reports on their species and functional diversities in urban habitats. To address this current controversy, we built a large dataset, merging 16 surveys carried out in 3 countries of Western Europe during the past decades, and tested whether urbanization influences local wild bee taxonomic and functional community composition. These surveys encompassed a range of urbanization levels, that were quantified using two complementary metrics: the proportion of impervious surfaces and the human population density. Urban expansion, when measured as a proportion of impervious surfaces, but not as human population density, was significantly and negatively correlated with wild bee community species richness. Taxonomic dissimilarity of the bee community was independent of both urbanization metrics. However, occurrence rates of functional traits revealed significant differences between lightly and highly urbanized communities, for both urbanization metrics. With higher human population density, probabilities of occurrence of above-ground nesters, generalist and small species increased. With higher soil sealing, probabilities of occurrence of above-ground nesters, generalists and social bees increased as well. Overall, these results, based on a large European dataset, suggest that urbanization can have negative impacts on wild bee diversity. They further identify some traits favored in urban environments, showing that several wild bee species can thrive in cities.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Arthur Fauviau) 10 Nov 2022

https://hal.science/hal-03846951v1

[hal-05168055] Human contributions to global soundscapes are less predictable than the acoustic rhythms of wildlife

Across the world, human (anthropophonic) sounds add to sounds of biological (biophonic) and geophysical (geophonic) origin, with human contributions including both speech and technophony (sounds of technological devices). To characterize society’s contribution to the global soundscapes, we used passive acoustic recorders at 139 sites across 6 continents, sampling both urban green spaces and nearby pristine sites continuously for 3 years in a paired design. Recordings were characterized by bird species richness and by 14 complementary acoustic indices. By relating each index to seasonal, diurnal, climatic and anthropogenic factors, we show here that latitude, time of day and day of year each predict a substantial proportion of variation in key metrics of biophony—whereas anthropophony (speech and traffic) show less predictable patterns. Compared to pristine sites, the soundscape of urban green spaces is more dominated by technophony and less diverse in terms of acoustic energy across frequencies and time steps, with less instances of quiet. We conclude that the global soundscape is formed from a highly predictable rhythm in biophony, with added noise from geophony and anthropophony. At urban sites, animals experience an increasingly noisy background of sound, which poses challenges to efficient communication.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Panu Somervuo) 09 Oct 2025

https://univ-rennes.hal.science/hal-05168055v1

[hal-04498528] Dataset documenting prevalence and counts of pine processionary moth tents on local host trees in 3 regions of France with different climatic environments

The pine processionary moth Thaumetopoea pityocampa is a defoliating lepidopter that develops during winter. The larvae are gregarious and bear urticating setae that are harmful to humans and vertebrates. They shelter in conspicuous silk tents that are easy to detect. We here present a dataset comprising tree characterization and tent counts from 3 agglomerations in France located in regions with different climatic environments. The studied trees belong to various conifer species that are potential hosts for the caterpillars. In each site, we defined clusters as one target tree and its 10–62 nearest neighbors, and surveyed each tree within the clusters by informing: tree species, coordinates, size, number of tents. We characterized a total of 3690 trees, including 2009 trees in Orléans (grouped in 68 clusters), 359 trees in La Baule (18 clusters) and 1322 trees in Montpellier (52 clusters). We provide the raw data characterizing each individual tree, graphs showing the prevalence and mean number of tents for the tree species included in the survey, and maps allowing to locate each tree. This dataset brings information about host preference of the pine processionary moth and will be useful as a baseline to study spatio-temporal variability of host-insect relationships. It can also be informative for decision-makers and managers of urban greenings to avoid trees that are likely to be heavily infested for plantation in proximity to vulnerable people.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Carole Kerdelhué) 11 Mar 2024

https://hal.inrae.fr/hal-04498528v1

[hal-04449380] Multi-tissue metabolic and transcriptomic responses to a short-term heat stress in swine

Background Heat stress (HS) is an increasing threat for pig production with a wide range of impacts. When submitted to high temperatures, pigs will use a variety of strategies to alleviate the effect of HS. While systemic adaptations are well known, tissue-specific changes remain poorly understood. In this study, thirty-two pigs were submitted to a 5-day HS at 32 °C. Results Transcriptomic and metabolomic analyses were performed on several tissues. The results revealed differentially expressed genes and metabolites in different tissues. Specifically, 481, 1774, 71, 1572, 17, 164, and 169 genes were differentially expressed in muscle, adipose tissue, liver, blood, thyroid, pituitary, and adrenal glands, respectively. Regulatory glands (pituitary, thyroid, and adrenal) had a lower number of regulated genes, perhaps indicating an earlier sensitivity to HS. In addition, 7, 8, 2, and 8 metabolites were differentially produced in muscle, liver, plasma, and urine, respectively. The study also focused on the oxidative stress pathway in muscle and liver by performing a correlation analysis between genes and metabolites. Conclusions This study has identified various adaptation mechanisms in swine that enable them to cope with heat stress (HS). These mechanisms include a global decrease in energetic metabolism, as well as changes in metabolic precursors that are linked with protein and lipid catabolism and anabolism. Notably, the adaptation mechanisms differ significantly between regulatory (pituitary, thyroid and adrenal glands) and effector tissues (muscle, adipose tissue, liver and blood). Our findings provide new insights into the comprehension of HS adaptation mechanisms in swine.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Guilhem Huau) 12 Feb 2024

https://hal.inrae.fr/hal-04449380v1

[hal-03609676] A first inference of the phylogeography of the worldwide invader Xylosandrus compactus

Native to Southeastern Asia, the ambrosia beetle Xylosandrus compactus is invasive worldwide. Its invasion is favoured by its cryptic lifestyle, symbiosis with a fungus that facilitates a broad range of host plants, and predominant sib-mating reproduction. X. compactus invaded Africa more than a century ago and the Americas and Pacific Islands in the middle of the twentieth century. It was not detected in Europe before 2011, when it was first reported in Italy before quickly spreading to France, Greece and Spain. Despite the negative environmental, agricultural and economic consequences of the invasion of X. compactus, its invasion history and main pathways remain poorly documented. We used COI and RAD sequencing to (i) characterise the worldwide genetic structure of the species, (ii) disentangle the origin(s) of the non-native populations on the three invaded continents and (iii) analyse the genetic diversity and pathways within each invaded region. Three mitochondrial lineages were identified in the native range. Populations invading Europe and the American-Pacific region originated from the first lineage and were only slightly genetically differentiated at nuclear SNP markers, suggesting independent introductions from close sources in or near Shanghai, ca. 60 years apart. Populations invading Africa originated from the second lineage, likely from India or Vietnam.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Teddy Urvois) 06 Sep 2023

https://hal.inrae.fr/hal-03609676v1

[hal-04160901] Effects of climate warming on the pine processionary moth at the southern edge of its range: a retrospective analysis on egg survival in Tunisia

Abstract In recent years, ectotherm species have largely been impacted by extreme climate events, essentially heatwaves. In Tunisia, the pine processionary moth (PPM), Thaumetopoea pityocampa , is a highly damaging pine defoliator, which typically lays eggs in summer. Its geographical range is expanding northwards in Europe while retracting from South Tunisia where summer temperatures can reach extremely high values. In this study, we aimed at exploring the effects of climate change on this species at its southern range edge. We investigated variations of fecundity and causes of egg mortality over time using historical and contemporary collections of egg masses from different Tunisian sites to seek relationships with regional climate change over three decades (1990-2019). Our results suggest negative effects of summer heat on egg survival, reflected in a decrease of hatching rate down to 0% in one site during a heatwave. Such a high hatching failure was found to result from both high egg sterility (our results did not allow distinguishing impeded mating success from failed egg maturation or early death of the embryo) and increased abortion of more developed embryos, but little effects of parasitism rate, thereby suggesting vulnerability to heat during embryonic development. We also observed decreasing female fecundity ( i.e ., number of eggs laid per female) in regions where data were available both in the 1990s and the 2010s, which was associated with a decrease in parasitism rate, while the climatic variability increased. This study investigated direct hatching failure in nature that may be related to the magnitude of warming in summer. Previous studies have confirmed the thermal sensitivity of early instars of the PPM to temperatures observed in the present work, including one population from South Tunisia. However, further work is required to evaluate the relative importance of warming summers among populations because the risk of heat stress depends on the phenology of sensitive instars, and populations from the warmest areas may not necessarily be the most vulnerable to climate change if they already evolved phenological heat avoidance. In addition to heat-induced mortality, the ultimate fitness of individuals that survive challenging heat stresses during early developmental stages should also be explored to determine potential carry-over effects on subsequent life stages.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Asma Bourougaaoui) 12 Jul 2023

https://hal.inrae.fr/hal-04160901v1

[hal-05070459] Complex population genetic structure of the bark beetle predator Thanasimus formicarius (L.) (Coleoptera: Cleridae) across its European range

Abstract Thanasimus formicarius (L.) (Coleoptera: Cleridae) is an important bark beetle predator and can reduce bark beetle population densities of some of the most severe forest pests in Europe. We analysed the population genetics and phylogeography of T. formicarius across its European range, using mitochondrial COI data from 187 individuals sampled from 23 locations. Our extensive sampling from the Fennoscandian to the Mediterranean region and from Iberia to the Middle East provides insights into the genetic structure of T. formicarius . We found a high genetic diversity, revealing 119 haplotypes across the sampling range. Two main clades, an Atlantic and a Continental, were identified, suggesting the presence of at least two glacial refugia during the last ice ages. An isolated population was discovered on the island of Corsica, suggesting that a limited number of individuals, probably from mainland France, may have colonized Corsica and a founder effect occurred. These findings increase our understanding of the recent evolutionary history of T. formicarius , which was shaped by Pleistocene events and certain species‐specific life‐history traits.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Eva Papek) 16 May 2025

https://hal.inrae.fr/hal-05070459v1

[hal-04871434] Tracking the North American Asian Longhorned Beetle Invasion With Genomics

Biological invasions pose significant threats to ecological and economic stability, with invasive pests like the Asian longhorned beetle (Anoplophora glabripennis Motschulsky, ALB) causing substantial damage to forest ecosystems. Effective pest management relies on comprehensive knowledge of the insect's biology and invasion history. This study uses genomics to address these knowledge gaps and inform existing biosurveillance frameworks. We used 2768 genome-wide single nucleotide polymorphisms to compare invasive A. glabripennis populations in North America, using genomic variation to trace their sources of invasion and spread patterns, thereby refining our understanding of this species' invasion history. We found that most North American A. glabripennis infestations were distinct, resulting from multiple independent introductions from the native range. Following their introduction, all invasive populations experienced a genetic bottleneck which was followed by a population expansion, with a few also showing secondary spread to satellite infestations. Our study provides a foundation for a genome-based biosurveillance tool that can be used to clarify the origin of intercepted individuals, allowing regulatory agencies to strengthen biosecurity measures against this invasive beetle.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Mingming Cui) 07 Jan 2025

https://hal.inrae.fr/hal-04871434v1

[hal-04534667] Intraspecific niche models for the invasive ambrosia beetle Xylosandrus crassiusculus suggest contrasted responses to climate change

Xylosandrus crassiusculus is an invasive ambrosia beetle comprising two differentiated genetic lineages, named cluster 1 and cluster 2. These lineages invaded different parts of the world at different periods of time. We tested whether they exhibited different climatic niches using Schoener's D and Hellinger's I indices and modeled their current potential geographical ranges using the Maxent algorithm. The resulting models were projected according to future and recent past climate datasets for Europe and the Mediterranean region. The future projections were performed for the periods 2041-2070 and 2071-2100 using 3 SSPs and 5 GCMs. The genetic lineages exhibited different climate niches. Parts of Europe, the Americas, Sub-Saharan Africa, Asia, and Oceania were evaluated as suitable for cluster 1. Parts of Europe, South America, Central and South Africa, Asia, and Oceania were considered as suitable for cluster 2. Models projection under future climate scenarios indicated a decrease in climate suitability in Southern Europe and an increase in North Eastern Europe in 2071-2100. Most of Southern and Western Europe was evaluated as already suitable for both clusters in the early twentieth century. Our results show that large climatically suitable regions still remain uncolonized and that climate change will affect the geographical distribution of climatically suitable areas. Climate conditions in Europe were favorable in the twentieth century, suggesting that the recent colonization of Europe is rather due to an increase in propagule pressure via international trade than to recent environmental changes.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Teddy Urvois) 01 Aug 2024

https://hal.inrae.fr/hal-04534667v1

[hal-04132693] The worldwide invasion history of a pest ambrosia beetle inferred using population genomics

Xylosandrus crassiusculus, a fungus-farming wood borer native to Southeastern Asia, is the most rapidly spreading invasive ambrosia species worldwide. Previous studies focusing on its genetic structure suggested the existence of cryptic genetic variation in this species. Yet, these studies used different genetic markers, focused on different geographical areas, and did not include Europe. Our first goal was to determine the worldwide genetic structure of this species based on both mitochondrial and genomic markers. Our second goal was to study X. crassiusculus' invasion history on a global level and identify the origins of the invasion in Europe. We used a COI and RAD sequencing design to characterize 188 and 206 specimens worldwide, building the most comprehensive genetic dataset for any ambrosia beetle to date. The results were largely consistent between markers. Two differentiated genetic clusters were invasive, albeit in different regions of the world. The two markers were inconsistent only for a few specimens found exclusively in Japan. Mainland USA could have acted as a source for further expansion to Canada and Argentina through stepping-stone expansion and bridgehead events. We showed that Europe was only colonized by Cluster 2 through a complex invasion history including several arrivals from multiple origins in the native area, and possibly including bridgehead from the USA. Our results also suggested that Spain .

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (T. Urvois) 19 Jun 2023

https://hal.inrae.fr/hal-04132693v1

[hal-04236301] The evolutionary history of capital-breeding moths through the lens of wild silkmoths (Saturniidae) phylogenomics

Wild silkmoths (Saturniidae) are large capital-breeding insects with non-feeding adults that have short lifespan entirely devoted to reproduction. They exhibit a dazzling diversity of sizes, forms, and life-histories inviting questions about the role that key traits may have played in spurring out species diversification and biogeographical movements in organisms with such extreme reproductive strategy. Yet, the absence of a robust phylogenetic framework based on comprehensive taxonomic sampling impedes our understanding of their evolutionary history. We analyzed 1,024 ultraconserved elements (UCEs) and their flanking regions to infer the relationships among 338 species of Saturniidae representing all subfamilies, tribes, and genera. We performed dating and historical biogeographic analyses to reconstruct their evolutionary history in space and time. Rather unexpectedly for a taxonomically well-known family such as Saturniidae, the alignment of taxonomic divisions and ranks with our phylogenetic results led us to propose substantial rearrangements of the family classification. Saturniids most likely originated in the Neotropics, shortly after the Cretaceous-Paleogene extinction event (ca 64.0-52.0 Ma). Old World lineages stemmed from two independent colonization events during the Eocene, presumably through the Bering-Land-Bridge. Extant subfamilies showed limited mobility across biogeographical regions, except for Saturniinae, a subfamily now present on all continents but Antarctica. These results provide a framework for the integration of saturniid evolutionary history into further global studies of biodiversity and conservation, as well as for in-depth investigations of the spatial and temporal dynamics in all lineages and of the role that key innovations played in driving species diversification of these capital-breeding moths.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Rodolphe Rougerie) 10 Oct 2023

https://hal.inrae.fr/hal-04236301v1

[tel-00717391] Expansion d'un ravageur forestier sous l'effet du réchauffement climatique : la processionnaire du pin affecte-t-elle la biodiversité entomologique dans les zones nouvellement colonisées ?

Sous les latitudes tempérées, les aires de distribution respectives des espèces d’insectes sont généralement conditionnées par les températures hivernales au travers de seuils minimaux de tolérance pour la survie et le développement. Ainsi, le déplacement des aires de répartition est un des effets les plus notables du réchauffement climatique sur les espèces sensibles au froid. Cependant, les conséquences de la colonisation de nouveaux milieux par les espèces en expansion, notamment sur les interactions interspécifiques restent largement inexplorées. La processionnaire du pin est un ravageur d’origine méditerranéenne, dont l’aire de répartition s’est considérablement étendue vers le nord et en altitude ces deux dernières décennies. Cette expansion est liée à la hausse des températures hivernales qui permet une meilleure survie des colonies se développant durant cette période. Notre étude s’est développée autour de deux axes de recherches : (1) la réponse des ennemis naturels à l’expansion de leur hôte ; (2) l’impact de la colonisation sur une espèce protégée inféodée à la même ressource alimentaire, l’Isabelle de France. Nos résultats ont montré que dans les zones nouvellement colonisées, la processionnaire du pin est libérée de la pression de ses parasitoïdes oophages. Ainsi, au niveau du front d’expansion, une femelle de processionnaire du pin produira plus de descendants que dans le coeur de son aire de répartition. De plus, la défoliation par la processionnaire du pin a un effet négatif sur le développement des chenilles d’Isabelle de France. Nos résultats contribuent à comprendre les causes de l’expansion de ce ravageur forestier et ses conséquences sur les espèces autochtones des zones nouvellement colonisées.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Charles-Edouard Imbert) 12 Jul 2012

https://theses.hal.science/tel-00717391v1

[hal-03464437] A comparative genomic approach using mouse and fruit fly data to discover genes involved in testis function in hymenopterans with a focus on Nasonia vitripennis

Abstract Background Spermatogenesis appears to be a relatively well-conserved process even among distantly related animal taxa such as invertebrates and vertebrates. Although Hymenopterans share many characteristics with other organisms, their complex haplodiploid reproduction system is still relatively unknown. However, they serve as a complementary insect model to Drosophila for studying functional male fertility. In this study, we used a comparative method combining taxonomic, phenotypic data and gene expression to identify candidate genes that could play a significant role in spermatogenesis in hymenopterans. Results Of the 546 mouse genes predominantly or exclusively expressed in the mouse testes, 36% had at least one ortholog in the fruit fly. Of these genes, 68% had at least one ortholog in one of the six hymenopteran species we examined. Based on their gene expression profiles in fruit fly testes, 71 of these genes were hypothesized to play a marked role in testis function. Forty-three of these 71 genes had an ortholog in at least one of the six hymenopteran species examined, and their enriched GO terms were related to the G2/M transition or to cilium organization, assembly, or movement. Second, of the 379 genes putatively involved in male fertility in Drosophila, 224 had at least one ortholog in each of the six Hymenoptera species. Finally, we showed that 199 of these genes were expressed in early pupal testis in Nasonia vitripennis ; 86 exhibited a high level of expression, and 54 displayed modulated expression during meiosis. Conclusions In this study combining phylogenetic and experimental approaches, we highlighted genes that may have a major role in gametogenesis in hymenopterans; an essential prerequisite for further research on functional importance of these genes.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Charlotte Lécureuil) 06 Sep 2022

https://hal.inrae.fr/hal-03464437v1

[hal-01144571] THE 2014 ALMA LONG BASELINE CAMPAIGN: AN OVERVIEW

A major goal of the Atacama Large Millimeter/submillimeter Array (ALMA) is to make accurate images with resolutions of tens of milliarcseconds, which at submillimeter (submm) wavelengths requires baselines up to ~15 km. To develop and test this capability, a Long Baseline Campaign (LBC) was carried out from September to late November 2014, culminating in end-to-end observations, calibrations, and imaging of selected Science Verification (SV) targets. This paper presents an overview of the campaign and its main results, including an investigation of the short-term coherence properties and systematic phase errors over the long baselines at the ALMA site, a summary of the SV targets and observations, and recommendations for science observing strategies at long baselines. Deep ALMA images of the quasar 3C138 at 97 and 241 GHz are also compared to VLA 43 GHz results, demonstrating an agreement at a level of a few percent. As a result of the extensive program of LBC testing, the highly successful SV imaging at long baselines achieved angular resolutions as fine as 19 mas at ~350 GHz. Observing with ALMA on baselines of up to 15 km is now possible, and opens up new parameter space for submm astronomy.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Alma Partnership) 22 Apr 2015

https://hal.science/hal-01144571v1

[hal-05521279] Multi-colored traps can enhance monitoring programs for native and non-native longhorn beetles in forest ecosystems

<div><p>Longhorn beetles (Coleoptera: Cerambycidae) are one of the most diverse families of beetles worldwide and they play critical roles in forest environments. Monitoring longhorn beetles is essential for both conservation and pest management, and baited traps are widely used for this purpose. Longhorn beetle species vary in their visual ecology and are attracted to different trap colors. A way to optimize trapping efficiency could be to combine multiple colors on a single trap, so to create a trap that captures multiple species at once. To test this approach, we carried out seven trapping experiments in Europe and North America, comparing the effectiveness of a multicolored trap against single-colored black, red, white, and yellow traps at whole family, subfamily, and species level. At most sites, multi-colored traps captured significantly more species and individuals than black, red, and/ or yellow traps. At the subfamily level, at most sites, multi-colored traps were equally or more effective than single-colored traps for Cerambycinae and Lamiinae. For Lepturinae, multi-colored traps were generally significantly more effective than black or red traps, but significantly less effective than white traps. Responses varied among species. Overall, our study suggests that the use of multi-colored traps can improve monitoring programs for longhorn beetles, supporting both faunistic surveys and early detection efforts targeting non-native species.</p></div>

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Laura Besana) 20 Feb 2026

https://hal.inrae.fr/hal-05521279v1

[hal-05388136] DAISIE - Inventory of alien invasive species in Europe

The DAISIE - inventory of alien invasive species in Europe is a species checklist dataset published by the Research Institute for Nature and Forest (INBO) and the Centre for Ecology and Hydrology (CEH). It contains information on 12,104 taxa (mostly species and mostly introduced) occurring in the wild in Europe since 1500. It covers a broad taxonomic spectrum of terrestrial and aquatic free living and parasitic organisms. The collation of the alien species list is the result of the efforts of the DAISIE (http://www.europe-aliens.org) project partners and more than 300 collaborators from Europe and neighbouring countries, involved in different fields of expertise and organisations. Here the DAISIE checklist is published as a standardized Darwin Core Archive and includes for each species: the scientific name, higher classification, and stable taxon identifier (in the taxon core), the vernacular names (in the vernacular names extension), the presence in a specific region, the year of the first introduction (first collection) and/or last assessment/observation in that region, as well as extra information (in the distribution extension), and the habitat, native range, and ecofunctional group (in the description extension). The DAISIE dataset is no longer maintained, but can be used as a historical archive for researching and managing alien plants or compiling regional and national registries of alien species. Issues with the dataset can be reported at https://github.com/trias-project/daisie-checklist. We have released this dataset under a Creative Commons Attribution license (CC-BY 4.0). We would appreciate it if you follow the GBIF citation guidelines (https://www.gbif.org/citation-guidelines) when using the data. If you have any questions regarding this dataset, don’t hesitate to contact us via the contact information provided in the metadata or via https://twitter.com/trias_project. The publication of the checklist to GBIF was supported by the European Cooperation in Science and Technology (COST) action Alien CSI “CA17122 - Increasing understanding of alien species through citizen science” as a Short Term Scientific Mission “Publishing alien species checklist data for Europe through repeatable, open workflows”, with technical support provided by the Research Institute for Nature and Forest (INBO).

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (David Roy) 28 Nov 2025

https://hal.inrae.fr/hal-05388136v1

[hal-02648090] Geographical Variations of the Essential Oils in Natural Populations of Cupressus atlantica Gaussen in High Atlas Mountains (Morocco)

The compositions of the essential oils isolated from leaves of five natural populations of Cupressus atlantica (Cupressaceae), an endemic species from Morocco, were investigated by GC-FID and GC-MS. The analysis showed sixty one constituents, of which fifty seven constituents were identified, accounting for 83.8-95.5 % of the total oils. These oils were dominated by the sesquiterpene hydrocarbons; four of them (germacrene D, delta-cadinene, gamma-cadinene and beta-caryophyllene,) constituted 21- 52.2 % of the oil, except for Talat N'os population which showed a high rate of monoterpene hydrocarbons (41.4 %). Quantitative, rather than qualitative difference of components found in the essential oil was noted. This variation seems to depend on environmental aspects existing in the plant collection sites.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (My Youssef Arjouni) 29 May 2020

https://hal.inrae.fr/hal-02648090v1

[hal-02637388] The EASIN Editorial Board: quality assurance, exchange and sharing of alien species information in Europe

The European Alien Species Information Network (EASIN) aims to facilitate the exploration of alien species information in Europe, and is recognized as the information system supporting European Union Member States in the implementation of the recently published Invasive Alien Species Regulation. In this paper, we present the role and activities of the EASIN Editorial Board (EB), which is responsible for the quality assurance, safeguarding and constant improvement of EASIN. The EB is supported by a web platform that facilitates online discussions about alien species. This platform creates a virtual community by providing a forum-like interface that is moderated by the EB Members but is freely accessible to the scientific community and the general public. It allows all registered users to make comments, raise questions and share experience and expertise on alien species in Europe. Moreover, it provides a means for exchanging opinions and solving disputes in a transparent way. The overall EB activity is commonly agreed upon procedures and standards.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Konstantinos Tsiamis) 28 May 2020

https://hal.inrae.fr/hal-02637388v1

[hal-05485107] From forest decline to salvage logging: cascading impacts on saproxylic beetle diversity

Understanding the cascading effects of forest decline on saproxylic communities is fundamental for optimizing the management of disturbed forests toward biodiversity conservation objectives. We postulated that the nature and intensity of cascading pathways would vary along decline gradients, encompassing stages from stand decline to mortality and subsequent salvage logging, as mediated by shifts in habitat conditions and resource availability. This study was conducted across three representative European forest contexts: fir forests in the French Pyrenees, spruce forests in the Bavarian Alps, and oak forests in the lowlands of the Loire Valley. Within these systems, we assessed how the taxonomic and functional α-diversity of saproxylic beetles responded to variations in both the diversity and density of deadwood and tree-related microhabitats (TreMs). Our analyses identified key cascading effects of stand decline and mortality that were shaped by the considered beetle guild and by the forest type, reflecting tree species–specific disturbance legacies. Stand decline and mortality produced distinct responses within saproxylic beetle assemblages, as different successional guilds preferentially utilized either dying or dead trees. The overall influence of decline processes was positive in conifer-dominated forests. TreMs played a central role in mediating cascading processes structuring saproxylic beetle communities throughout the forest decline continuum. The increase in TreM heterogeneity associated with stand decline or mortality enhanced saproxylic diversity, with exposed wood and trunk injuries identified as particularly influential microhabitats. Snags and large deadwood elements, especially in spruce forests, and deadwood diversity further contributed to sustaining high levels of beetle diversity. Conversely, salvage logging exerted detrimental effects on numerous guilds, primarily through reductions in TreM diversity, decreased TreM trait dispersion, and the depletion of saproxylic TreMs. Given the pronounced context dependency of the processes driving these cascading community dynamics, and considering the increasing frequency, severity, and spatial extent of forest disturbances and global forest decline, it is imperative to integrate this complexity into management and conservation frameworks. Addressing these mechanisms with greater precision will be critical for maintaining functional biodiversity within rapidly changing forest ecosystems.

ano.nymous@ccsd.cnrs.fr.invalid (Jérémy Cours) 30 Jan 2026

https://hal.inrae.fr/hal-05485107v1

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